| 1 |  Damiano Cunego (ITA) | Lampre - Fondital | 4.20.21 (39.593 km/h) |
| 2 |  Alejandro Valverde Belmonte (SPA) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 3 |  Kjell Carlström (FIN) | Liquigas | s.t. |
| 4 | Mikel Astarloza Chaurreau (SPA) | Euskaltel - Euskadi | s.t. |
| 5 |  Alexandr Kolobnev (RUS) | Team CSC - Saxo Bank | 0.12 |
| 6 | Paolo Tiralongo (ITA) | Lampre - Fondital | s.t. |
| 7 | Jaume Rovira Pous (SPA) | Extremadura - Grupo Gallardo | s.t. |
| 8 | Josep Jufre Pou (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 9 | Beñat Intxausti Elorriaga (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 10 | Egoi Martinez De Esteban (SPA) | Euskaltel - Euskadi | s.t. |
| 11 |  Chris Anker Sørensen (DEN) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 12 | Mikel Nieve Iturralde (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 13 | Julian Sanchez Pimienta (SPA) | Contentpolis - Murcia | s.t. |
| 14 | Joaquim Rodríguez Oliver (SPA) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 15 | Ezequiel Mosquera Miguez (SPA) | Karpin - Galicia | s.t. |
| 16 | David Arroyo Duran (SPA) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 17 |  Fränk Schleck (LUX) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 18 | Carlos Sastre Candil (SPA) | Team CSC - Saxo Bank | 0.23 |
| 19 | Amets Txurruka Ansola (SPA) | Euskaltel - Euskadi | 0.44 |
| 20 | Dario Cataldo (ITA) | Liquigas | s.t. |
| 21 | Manuel Beltran Martinez (SPA) | Liquigas | s.t. |
| 22 | Javier Etxarri Marin (SPA) | Contentpolis - Murcia | s.t. |
| 23 | Andy Schleck (LUX) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 24 | Nicolas Jonathan Castroviejo (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 25 |  Volodymir Gustov (UKR) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 26 | Sergio Pardilla Bellón (SPA) | Burgos Monumental | s.t. |
| 27 | Alberto Fernandez De La Puebla Ramos (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 28 | José Ángel Gómez Marchante (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 29 | Roman Klimov (RUS) | Team Katusha | 1.37 |
| 30 |  Matej Mugerli (SLO) | Liquigas | 1.44 |
| 31 | Luis Roberto Alvarez Martín (SPA) | Burgos Monumental | s.t. |
| 32 |  Philip Deignan (IRL) | AG2R - La Mondiale | s.t. |
| 33 | Daniel Sesma Sorbet (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 34 | Eduard Vorganov (RUS) | Karpin - Galicia | s.t. |
| 35 |  Hubert Dupont (FRA) | AG2R - La Mondiale | s.t. |
| 36 | Julien Loubet (FRA) | AG2R - La Mondiale | s.t. |
| 37 | Sergio Dominguez Munoz (SPA) | Contentpolis - Murcia | s.t. |
| 38 | Iban Mayoz Etxebarria (SPA) | Karpin - Galicia | s.t. |
| 39 | Iker Camano Ortuzari (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 40 | Miguel Minguez Ayala (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 41 | Jesus Ramirez Torres (SPA) | Extremadura - Grupo Gallardo | s.t. |
| 42 | Juan Olmo Menacho (SPA) | Andalucía - Cajasur | s.t. |
| 43 | Francisco Javier 'Patxi' Vila Errandonea (SPA) | Lampre - Fondital | 1.47 |
| 44 | Francisco José Terciado Sacedo (SPA) | Extremadura - Grupo Gallardo | s.t. |
| 45 | Andres Avelino Antuña Coro (SPA) | Burgos Monumental | s.t. |
| 46 |  Gustav Erik Larsson (SWE) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 47 | Alberto Losada Alguacil (SPA) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 48 | Iñigo Cuesta Lopez De Castro (SPA) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 49 | Andrey Solomennikov (RUS) | Team Katusha | 1.54 |
| 50 | David De La Fuente Rasilla (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 51 | Matteo Bono (ITA) | Lampre - Fondital | s.t. |
| 52 | Leonardo Piepoli (ITA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 53 | Ruben Lobato Elvira (SPA) | Saunier Duval - Scott | s.t. |
| 54 | Javier Moreno Bazan (SPA) | Andalucía - Cajasur | 1.59 |
| 55 | Dmitry Kosyakov (RUS) | Team Katusha | 2.12 |
| 56 | Xabat Ochotorena Arraras (SPA) | Extremadura - Grupo Gallardo | 2.25 |
| 57 | Ruben Perez Moreno (SPA) | Euskaltel - Euskadi | 3.44 |
| 58 | Iván Melero Coco (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 59 | Blaise Sonnery (FRA) | AG2R - La Mondiale | 4.50 |
| 60 | David Lopez Garcia (SPA) | Caisse d'Epargne | 5.35 |
| 61 | Dionisio Galparsoro Martinez (SPA) | Euskaltel - Euskadi | 5.59 |
| 62 | Pedro Gutierrez Alvarez (SPA) | Burgos Monumental | 7.02 |
| 63 | Raul Santamarta Valvuena (SPA) | Burgos Monumental | 7.12 |
| 64 | Rafael Serrano Fernandez (SPA) | Contentpolis - Murcia | s.t. |
| 65 | José Antonio Redondo Ramos (SPA) | Andalucía - Cajasur | s.t. |
| 66 | Eladio Sanchez Prado (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 67 | Luis Angel Maté Mardones (SPA) | Andalucía - Cajasur | s.t. |
| 68 | Enrique Mata Cabello (SPA) | Burgos Monumental | s.t. |
| 69 | Antonio Piedra Perez (SPA) | Andalucía - Cajasur | s.t. |
| 70 |  Marlon Alirio Perez Arango (COL) | Caisse d'Epargne | 8.59 |
| 71 | Aitor Galdos Alonso (SPA) | Euskaltel - Euskadi | s.t. |
| 72 | Igor Romero Etxebarria (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 73 | Aitor Olano Orbegozo (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 74 | Eriz Ruiz De Erentxun Antetara (SPA) | Orbea - Oreka S.d.a | s.t. |
| 75 | Francisco Javier Iriarte Garro (SPA) | Burgos Monumental | s.t. |
| 76 | Daniel Moreno Fernández (SPA) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 77 | Mikhail Antonov (RUS) | Team Katusha | s.t. |
| 78 |  Olegs Melehs (LAT) | Dynatek - Latvia | s.t. |
| 79 | Daniil Komkov (RUS) | Team Katusha | s.t. |
| 80 | Alexander Porsev (RUS) | Team Katusha | s.t. |
| 81 | Alexei Kunshin (RUS) | Team Katusha | s.t. |
| 82 |  Jurgen Van Goolen (BEL) | Team CSC - Saxo Bank | s.t. |
| 83 | Juan Javier Estrada Ruiz (SPA) | Andalucía - Cajasur | s.t. |
| 84 | Valerio Agnoli (ITA) | Liquigas | s.t. |
| 85 | Rigoberto Uran Uran (COL) | Caisse d'Epargne | s.t. |
| 86 | Alberto Fernandez Sainz (SPA) | Karpin - Galicia | s.t. |
| 87 | Jorge Azanza Soto (SPA) | Euskaltel - Euskadi | s.t. |
| 88 | Israel Perez Rodriguez (SPA) | Extremadura - Grupo Gallardo | s.t. |
| 89 | Marco Marzano (ITA) | Lampre - Fondital | s.t. |
| 90 | Serafín Martínez Acevedo (SPA) | Karpin - Galicia | 12.28 |
| 91 | Juan Francisco Mouron Doldan (SPA) | Karpin - Galicia | s.t. |
| 92 | Jorge Sanchez Pimienta (SPA) | Contentpolis - Murcia | s.t. |
| 93 | Nicolas Rousseau (FRA) | AG2R - La Mondiale | s.t. |
| 94 | David Francisco Delgado (SPA) | Burgos Monumental | 2), km 107.2 |
